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2023년 3월 27일
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사이언스 차이나 프레스(Science China Press)
최근 중국과학원 심해과학기술연구소 허 순핑(Shunping He) 박사가 이끄는 연구팀은 사이언스 차이나 라이프 사이언스(Science China Life Sciences) 온라인 버전에 연구 결과를 발표했습니다.
그들은 심해 적응의 분자 메커니즘을 밝히는 심해 뱀장어(Ilyophis brunneus)의 최초의 고품질 게놈을 보고했습니다. 심해 장어 샘플은 중국의 유인 잠수정 '선하이용시(Shen Hai Yong Shi)'가 마리아나 해구 수심 3,500m에서 채취했다. 연구진은 형태학적 관찰과 미토콘드리아 바코드 분석을 통해 해당 장어가 진흙투성이 화살이빨뱀장어(MAE)임을 확인했습니다.
장어의 심해 적응의 분자 메커니즘을 조사하기 위해 연구자들은 먼저 Illumina의 고처리량 시퀀싱, PacBio 및 Hi-C 기술을 사용하여 MAE의 고품질 게놈을 시퀀싱하고 조립했습니다. 그런 다음 그들은 그 기원과 적응 메커니즘을 밝히기 위해 계통발생학적 및 비교 게놈 분석을 수행했습니다.
이 연구는 세포골격을 유지하고 조절하는 것과 관련된 몇 가지 중요한 유전자가 강력한 양성 선택을 경험하는 TUGBCP3 및 ITGA 유전자와 같은 특정 돌연변이를 겪었다는 것을 밝혔습니다. TUBGCP3은 γ-튜불린 복합체의 필수 구성 요소이며 중심체의 미세소관 핵형성에 중요한 역할을 하는 반면, ITGA는 미세소관 세포골격 안정성을 촉진하고 세포골격 조립을 조절합니다.
연구자들은 또한 DNA 복구 능력, 막 유동성, 정상적인 전사 및 번역 과정, 에너지 대사와 관련된 많은 수의 유전자군이 확장, 양성 선택 및 급속한 진화를 겪었다는 사실을 발견했습니다.
또한, 심해뱀장어, 유럽뱀장어 및 기타 천해성 어종에 대한 선택압 분석 결과, 심해뱀장어의 Ω값이 다른 어종에 비해 현저히 높은 것으로 나타나 심해뱀장어가 극한의 심해 환경에서 기능적 가속 진화를 경험했을 가능성이 높습니다. 이러한 유전적 변이로 인해 심해 장어가 극한의 심해 환경에 적응하는 능력을 발전시킬 수 있게 되었을 수도 있습니다.
추가 정보: Jie Chen 외, 심해 뱀장어 Ilyophis brunneus의 유사 염색체 길이 게놈 어셈블리는 심해 적응에 대해 조명합니다. Science China Life Sciences(2023). DOI: 10.1007/s11427-022-2251-8
저널 정보:과학 중국 생명 과학
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